柴魚嘌呤通常較高。
柴魚當中含有豐富的氨基酸、蛋白質、脂肪以及多種微量元素，食用以後不僅可以幫助身體補充一定的營養，同時也具有化痰、止咳的作用。另外，柴魚也可以減少其他物質對腸胃產生刺激，有健脾益胃的作用。但是，柴魚屬於海鮮類食物，通常嘌呤的含量比較高，如果長期食用就可能會影響尿酸代謝，導致血尿酸增高以及痛風關節發作等疾病的機率增加。如果患有高膽固醇血癥、通風等疾病，一般不建議吃柴魚，主要是可能會導致體內膽固醇含量升高，以及體內嘌呤含量增加，使症狀加重，不利於治療以及恢復。
一般情況下，在吃柴魚時不能和冬瓜一起，否則可能會引起脫水。另外，也不建議和菠菜一起吃，這兩種食物相剋如果同時服用，可能會引起腸胃不適症狀，例如噁心、嘔吐、拉肚子等。
