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中國科學家破譯首個“現代蛙類”基因組

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記者4日從中國科學院獲悉,中國科學院院士、中國科學院昆明動物研究所研究員張亞平及其合作者已成功破譯高山倭蛙基因組。這是世界上首次破譯現代蛙類基因組,爲兩棲動物進化研究提供新線索。

中國科學家破譯首個“現代蛙類”基因組

兩棲動物代表着脊椎動物從水生到陸生這一轉變的過渡類羣,對於研究脊椎動物的進化模式極爲關鍵。儘管目前已知兩棲動物有7000多個物種,但科學家此前僅對熱帶爪蟾進行基因測定。由於熱帶爪蟾屬於古老蛙類,無法充分代表兩棲動物,人們對兩棲動物基因組特性的認識受到制約。

“我們首次在全基因組範圍內比較了兩棲動物內部的替換速率和重排速率,通過對蛙類基因組的測序和比較分析,對兩棲動物的進化有了更多的瞭解。”課題組成員、來自華大基因國家基因庫的研究人員熊子軍說。

屏蔽此推廣內容高山倭蛙系青藏高原的土著物種。它們普遍身長三四釐米,背部皮膚粗糙,大多呈橄欖灰色。研究人員將其與熱帶爪蟾的基因組進行對比後發現,高山倭蛙擁有更強大的基因組,其基因組序列約爲2.3Gb,比熱帶爪蟾多出0.8Gb。此外,兩者的分歧時間大約在2.66億年之前,但因兩物種染色體間重排少,說明蛙類基因組具有相對較慢的進化速率。

“高山倭蛙基因組的破譯,使我們進一步確認了更多的人類、鳥類、甚至蛙類基因組中的染色體斷裂和融合區域。”熊子軍說。

據介紹,四足動物已有3.6億年的進化史,科學家們通過分析染色體斷裂和融合事件,發現人的染色體間重排最劇烈,雞和兩棲動物染色體間重排相對較少,這意味着恆溫動物的進化速率高於冷血動物。

值得一提的是,高山倭蛙生活在海拔2850—4700米的地方,科學家此次還發現了其特有的三類抗菌肽,其中一類AP01583已被證實在氧化應激和應對病原微生物方面具有重要作用,也就是說抗菌肽可能是高山倭蛙適應高海拔環境的一項“法寶”。

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