研究表明，腸道菌羣對人體健康起到了非常重要的調節作用——有益菌產生消炎、抗氧化物質，合成營養成分，滋養和保護身體；有害菌則產生毒素、致癌物，可能引發認知功能障礙、肥胖甚至癌症。有一些飲食習慣會讓腸道中的有害菌加快生長繁殖，導致菌羣失衡，應該引起大家注意。
長期高油、高脂飲食，吃太多肉，植物類食物吃得少，會導致腸道中的壞細菌增多、好細菌減少，腸道產生的毒素增加，保護能力下降。此時，人體免疫系統就會介入，身體開始“發炎”。這種慢性炎症會引起脂肪異常堆積、肥胖，進而誘發胰島素抵抗、動脈粥樣硬化等改變，增加糖尿病、冠心病、神經退行性疾病、癌症等患病風險。
細菌，尤其是致病菌，在適宜的溫度下，再有營養豐富的培養基（食物），它們就大肆生長，造成食物中細菌成千倍、成萬倍地增多。如果平時飲食不注意衛生，進食了被細菌污染的食物，就使得進入腸道的壞“過路菌”數量遠超過“常駐菌”，這些壞細菌得勢後，通過侵襲腸道黏膜、釋放細菌毒素使機體的體溫升高，引發腹瀉等各種疾病。
這類食品往往經過精細加工，缺乏有益腸道蠕動的膳食纖維，不利於有益菌的生長繁殖，從而導致有害菌繁殖過快。有些加工食品中鹽的含量比較高，吃太多容易使胃腸道內形成高滲透壓環境，使腸道內水分無法被吸收，從而引起腸道問題，導致菌羣失衡。
研究發現，長期飲酒改變腸道微生態，導致有害菌大量生長，削弱了有益菌對腸黏膜的保護作用。吸菸幾乎損害身體的每一個器官，是導致炎症性腸病最重要的環境風險因素之一，而戒菸可以增加腸道菌羣的多樣性。
