提到細菌，多數人想到的首先是細菌會讓我們生病，會引起感染等等。其實並不是所以細菌都是“有害的”，我們與肉眼看不見的微生物生活在同一個世界。當我們免疫功能正常時，這些微生物對我們無害，有些還對人體有利，這些“安分守己”的微生物我們稱之爲正常菌羣。
我們的口腔、鼻腔、胃腸道也都存在着各種不同類型的微生物，其中以腸道中的微生物數量最多、種羣最豐富，大約80%的人體正常微生物都集中在這裏，它們的數量超過100萬億個（這個數字大約是人體細胞總數的十倍），以細菌爲主，種類有四五百種，絕大部分是不需要氧氣的厭氧細菌，總重量超過一公斤。
人在出生時身體上是沒有微生物的，但隨後幾小時內，微生物便通過呼吸、母乳等各種渠道進入人體、佔據合適的位置開始生息繁衍。並非所有微生物都能在人體順利定殖，經過8小時一輪的篩選，原意與人體和平共處的微生物被保留下來，成爲人體身上的正常菌羣。
這些細菌生活在腸道並非是多餘的，也不是有害的，人體細菌腸道細菌顯然也懂得雙贏的道理，腸道細菌在享受人體提供的生存空間時自然也感恩戴德。
它們能夠抑制外來病原微生物，外來病原微生物要想在人體內搗蛋就必須先在人體內找到立足點。因爲有着正常的微生物菌羣暫居了生存空間，外來病原微生物要奪取一個立足點必須要和體內原有的菌羣競爭，但大部分情況都是這些病原微生物敗下陣來。人體正常腸道細菌以逸待勞自然很容易打敗外來的入侵者，從而起到抵禦外來病原微生物。所以只要不“作亂”的腸道細菌都是良民，人體應與其和平共處，若亂用抗生素則會照成失衡，外來細菌容易趁機作亂。
人體正常微生物還能合成一些人體需要的營養物質供人體吸收如維生素合K、維生素B、煙酸等，此外，腸道微生物還有調節人的免疫力、降解食物中亞硝胺等致癌物質的功能。
同宏觀生態系統一樣，腸道微生態系統也應保持平衡，這種平衡對於人體健康至關重要，如果腸道微生態平衡被打破，人體或將患病。例如濫用抗生素常使腸道菌羣失調導致腹瀉，嚴重者還可發展爲難治的僞膜性腸炎。抗生素是把雙刃劍，能殺死致病菌同樣也能殺死很多正常的腸道微生物，繼而容易發生腸道微生態失衡。
也還有許多研究表明腸道微生物失調與自身免疫性疾病、腸易激綜合徵、肥胖、糖尿病等疾病的發生有關，甚至有研究表明肥胖與腸道內菌羣的改變有直接關係。
提到細菌，多數人想到的首先是細菌會讓我們生病，會引起感染等等。其實並不是所以細菌都是“有害的”，我們與肉眼看不見的微生物生活在同一個世界。當我們免疫功能正常時，這些微生物對我們無害，有些還對人體有利，這些“安分守己”的微生物我們稱之爲正常菌羣。
抗生素的使用可對腸道菌羣產生嚴重影響，很容易造成菌羣失調。因此使用抗生素一定需要按照醫囑使用，切勿濫用和過量使用；
高脂、高糖的飲食習慣會導致共生菌比例下降，從而造成腸道菌羣失調，因此一定要注意合理飲食；膳食纖維可作爲我們很多腸道細菌的食物。攝入膳食纖維過少會使某些細菌捱餓，捱餓後他們會開始吃大腸粘液外膜上的粘蛋白。
總而言之補充一些益生菌和均衡飲食可能有幫助，但目前這些研究纔剛起步，如何通過調節腸道菌羣來維持健康還有待進一步探討。
