自體輸血的禁忌症有腎肝功能不全、嚴重貧血不穩定和有膿毒症和菌血症的患者都不可自體輸血。
1、肝功能不全
肝功能不全的患者，血液中會包含有毒物質，肝的代謝功能受損，腎的排泄功能也有損傷，有毒物質不能及時的被排出而被清除，導致血液中含有比較多的有毒物質，所以肝功能不全的患者不宜進行自體輸血。
2、嚴重貧血不穩定的
嚴重貧血不穩定的患者，身體是一種血虛的情況，並且伴有缺氧症狀的各種骨髓增生低下的貧血，都不適合自體輸血。
3、有膿毒症和菌血症
患有膿毒症和菌血症的患者，主要是由於條件致病菌進入血液循環所引起的，會伴有發燒、咳嗽、尿頻和呼吸急促，心率增快的現象，這類患者是不宜進行自體輸血的。
除此之外，腹腔和胸腔開發性損傷超過4小時的患者，也不可進行自體輸血。是否可以進行自體輸血要遵循醫生的指導。
