磷脂酰絲氨酸一般不會產生過大的副作用，但若是長期大量攝入，就可能會造成身體肥胖、厭食、腹瀉的副作用產生。
1、身體肥胖
由於磷脂酰氨酸裏面含有大量的脂肪以及甘油等成分，在長期過量食用時，就會導致攝入的過量脂肪在機體內堆積造成肥胖。
2、厭食
磷脂酰絲氨酸裏富含的細菌和酵母菌等成分在被人體過量攝入後，還會對進食的慾望進行抑制，如果得不到控制，甚至會引起厭食。
3、腹瀉
過量的細菌和酵母菌被機體吸收，還會對胃腸道造成刺激，引起腸胃紊亂，造成消化不良、腹瀉、腹脹。
爲避免副作用產生，用藥一定注意在醫生指導下進行。
