流產後兩側小腹疼可能是生理因素引起的，也可能是病理因素導致的，如淤血逆流、宮腔感染等，需根據實際情況對症處理，具體分析如下：
一、生理因素
流產主要是通過人工干預或者是自然因素提前終止妊娠，此時女性身體較爲虛弱，如果不注意保暖，致使身體受涼，腹部肌肉痙攣，血管異常收縮，就可能會出現流產後兩側小腹疼情況，是正常現象。建議在恢復期間應，注意身體保暖，增加營養攝入。
二、病理因素
1、淤血逆流
如果在恢復期間進行劇烈的活動，子宮內膜創口產生的血液出現逆行現象，進而引起淤血逆流，致使局部壓力異常升高，引起此種情況。建議應前往醫院，通過手術的方式將淤血排出。
2、宮腔感染
如若患者不注意個人衛生或者過早進行性生活，致使外界細菌侵入宮腔內，引起炎症反應。炎症因子持續刺激子宮的周圍神經，引發上述現象。建議患者在醫生指導下使用頭孢克肟膠囊、甲硝唑片等藥物治療。
除此之外，還可能是子宮頸損傷、盆腔膿腫、宮腔粘連等病症造成的。如果此種情況持續時間比較長，還應儘早前往醫院進行相應治療。
