吃磷黴素氨丁三醇散後拉肚子，屬於該藥的常見不良反應之一。
磷黴素氨丁三醇散中的氨丁三醇，一般是用於使磷黴素水溶性增加的成分。但是部分患者的消化道對氨丁三醇較爲敏感，可能刺激胃腸道黏膜蠕動，分泌物增加，從而出現拉肚子的不良反應。大部分吃磷黴素氨丁三醇散的人羣會出現不同程度的腹瀉，其中大部分爲輕度腹瀉，即大便次數與平時相比每天增加小於4次，此時不伴有血便或其他明顯不適症狀，通常無須特殊處理和治療，停藥後可自行緩解。
如果大便次數每天比平時增加4-6次，爲中度腹瀉，如果比平時增加超過7次，則爲重度腹瀉，出現中重度腹瀉，建議立即停藥。因嚴重的腹瀉不僅影響藥物吸收，同時可造成極度不適，亦可造成脫水以及致死性腸炎。建議中重度的人羣給予口服補液鹽、乳酸菌素片等，調節胃腸道功能。
此外，因食物影響磷黴素氨丁三醇散的吸收，故建議服藥時間與進食時間隔開，可以飯前或飯後2-3小時服藥，同時爲減輕胃黏膜刺激，建議服藥期間禁止食用辛辣刺激性、生冷油膩的食物，避免飲酒。
