一般情況下，做完腸鏡第二天肚子咕咕叫可能是腸道清潔劑影響、腸易激綜合徵、腸炎等因素引起的，患者可以根據具體原因進行對症治療。具體分析如下：
1、腸道清潔劑影響
在進行腸鏡檢查前，需要進行腸道清潔，使用腸道清潔劑清洗腸道。腸道清潔劑可能會對腸道內的菌羣產生影響，導致腸道蠕動加快，引起腹部鳴叫的情況。這是正常情況，不用特殊治療，通常過段時間會自行痊癒。
2、腸易激綜合徵
長期食用高蛋白質的食物，可能會影響胃腸道消化功能，誘發腸易激綜合徵，出現腹痛、腹瀉等症狀。建議患者在醫生的指導下使用鹽酸美貝維林片、枸櫞酸阿爾維林膠囊等藥物進行治療，同時避免長期吃高蛋白質的食物。
3、腸炎
腸道受到細菌、病毒感染，可能會產生炎症反應。在進行腸鏡檢查時，會損傷腸黏膜，引起腸鳴、腹脹等症狀。建議患者在醫生的指導下使用乳酸菌素片、苦蔘膠囊等藥物進行治療，同時多注意休息。
