化驗檢查雖是肝炎、肝硬化和肝癌等診斷的重要依據,但不是唯一依據。對肝病的診斷,應將化驗檢查結果與臨牀症狀、體徵結合起來綜合分析,才能得出正確診斷。因此，對化驗檢查結果中的異常值，應具有科學態度，進行正確分析。
谷-丙轉氨酶(又稱丙氨酸轉氨酶，ALT),與谷-草轉氨酶(又稱天冬氨酸轉氨酶,AST),因主要分佈在肝細胞內，所以,當肝細胞壞死,血清中ALT和AST就會升高。其升高的程度與肝細胞受損的程度是致的,即肝細胞受損傷越大,則它們升高就越多，因此，它們是目前最常用的監測肝功能的指標。
雖然在肝細胞被大量破壞時,ALT和AST都可大幅度升高，但一般來說,測定血清ALT反映肝損害程度較AST更佳。ALT的正常值賴氏法爲20~35單位;AST的正常值賴氏法爲4~40單位。目前認爲，測定AST/ALT的比值有一定價值,正常人AST/ALT比值大於1;
急性肝炎和慢性肝炎的輕型，因肝功能表現爲ALT的升高，則AST/ALT的比值小於1;
重型肝炎和慢性肝炎的中型和重型，AST/ALT的比值等於1或大於1;
肝硬化、慢性活動性肝炎的AST/ALT的比值常大於1.4;
肝癌、心肌梗死時的AST/ALT比值常大於2;
酒精性肝病病人，AST的活性也常常大於ALT;
有些降轉氨酶的藥物也可以升高AST/ALT的比值，嚴重者還會出現黃疸，等等。因此，對慢性肝病病人在進行肝功能檢查時，不僅要檢測ALT這項指標，而且還要檢測AST。
鹼性磷酸酶(簡稱ALP或AKP),廣泛存在於人體肝臟、骨骼、牙齒、腎、胎盤等。正常值爲3~13金--阿氏單位,或布氏法1.5~4.0單位。它也是一種診斷肝膽系統疾病時常用的指標。阻塞性黃疸時，ALP升高達30單位以上。檢測黃疸型肝炎病人的ALT與ALP的比值有利於判斷其肝損害是以肝細胞壞死爲主，還是以膽汁淤積爲主。如果ALT升高到正常上限值的2倍以上時，而ALT/ALP的比值等於或大於5時，則說明病人的肝損害是以肝細胞壞死爲主;若ALT/ALP的比值等於或小於2時，那以肝內膽汁淤積爲主;如果ALT和ALP均升高，而且，ALT/IALP的比值在2~5之間，則表明病人存在肝細胞壞死和肝內膽汁淤積兩種病變。
如果僅有ALP一項指標升高，這不是肝臟病變造成的，不一定是肝功能異常。因爲,ALP廣泛存在於人體的多種器官和部位。正常人血清中的ALP主要來自骨骼,由成骨細胞產生，經血液到肝臟，從膽道系統排泄。如果ALT正常而僅出現ALP升高,要認真分析原因，不要盲目治療。有半數原發性肝癌病人ALP升高，而轉移性肝癌90%ALP升高，常在沒有黃疸之前即明顯升高。在肝病病人，如果血清膽紅素逐漸升高,而ALP不斷降低，表示肝臟有較嚴重的瀰漫性損害;反之，膽紅素下降,ALP降低，則表示肝細胞有再生，預後較好。
甲種胎兒球蛋白,簡稱甲胎蛋白(AFP)，是由胎兒的肝細胞、卵黃囊細胞和胃腸道上皮細胞產生，但主要由胎兒肝細胞合成，胎兒一生出來,就不再合成這種特殊蛋白，所以，稱它爲胎兒球蛋白,因此，除了孕婦和新生兒外,人體內都不應該有這種胎兒球蛋白存在。
在急性肝炎、慢性肝炎或肝硬化時,由於肝細胞損傷後的再生和幼稚化，肝細胞又製造AFP。血清中的AFP會輕度升高，一般不超過300微克升。這種升高不一定是壞事。使用一一些刺激肝細胞再生的藥物(如促肝細胞生長素)後,也可出現AFP短時間升高。在肝炎嚴重時,尤其是亞急性重型肝炎，查AFP有助於判斷預後。
雖然AFP升高不一定都是肝癌,但在原發性和繼發性肝癌時，肝癌細胞有合成AFP的能力，使病人血清中的AFP常明顯升高，超過400微克升(放射免疫定量法)甚至高達1000微克升,或呈進行性升高。因此AFP升高可用於肝癌的早期的輔助診斷、療效考覈和判斷預後的指標。如果AFP升高超過500微克升，持續1個月以上，就能排除妊娠、活動性肝炎及生殖系統胚胎性腫瘤(如睾丸和卵巢畸胎瘤)、消化道腫瘤、胰腺癌等，即使無其他肝癌證據，也可考慮爲原發性肝細胞癌。肝癌手術後,AFP會逐漸下降,若下降不明顯,說明手術不徹底或復發，若不下降，說明肝癌復發。當然，利用AFP升高診斷肝癌時，還要認真排除假陽性的干擾，並考慮其他疾病可能弓|起的AFP升高等。
血清肝纖維化四項指標是指透明質酸(HA)、層黏蛋白(LN)、IV型膠原(C--IV)和工型前膠原(PC一皿)。這些指標的升高常表示肝組織內的纖維化形成,但其特異性不強，不能作爲肝硬化診斷的金標準。因此,不能因這些指標的輕度異常或某一兩項指標異常就認爲得了肝硬化。而要結合其他檢測結果、臨牀症狀、體徵綜合判斷。因爲，其他臟器的疾病也可以引起幾項纖維化指標的異常。
