國家重點實驗室也難做到確實判斷基因情況基因檢測的發展，得益於2006年人類完整基因圖譜的繪製完成。但由於缺乏相關的准入標準和管理規範，2014年初，國家食藥監總局、衛計委等部門曾聯合發文一度叫停基因測序臨牀應用，其中就包括用於疾病預測的基因檢測。
“現在商業基因檢測項目魚龍混雜。事實上，很多檢測項目是直接將國內外基礎科研文獻中對基因功能研究的結果作爲解讀依據，這樣的做法在臨牀級別的檢測產品上是不恰當的。精準醫學不只是嘴上功夫、分析能力，能夠確實地判斷基因情況，即使國家重點實驗室做到也很難。”常子嵩透露，基因研究技術含量很高，尚處於初始階段，還不適合推廣，此時用於公衆的臨牀檢測爲時尚早。並且基因研究是個龐大的工程，人類的很多基因祕密還未被探知，目前揭示出來的只是冰山一角。基因檢測僅僅是將其中研究的相對確切的成果進行轉化，而轉化出來的檢驗方法是要經過臨牀試驗驗證的。
此外，由於基因檢測方法和依據有差別，導致最終的解讀結果可能截然相反。測序儀產地各不相同，各家基因公司使用方法和檢測標準也有差別，加上試劑不一、使用的數據庫不同，可能導致同一個人在不同公司做的基因檢測，結果也會有差異。另外，對基因檢測結果還需要既有生物醫學專業素質，又對基因檢測有深度瞭解的高層次生物工程人才來解讀。
基因檢測行業涉及衆多細分領域，如機構、儀器、試劑、技術等，不同的領域歸口於不同的監管部門。其中，衛計委主要負責審查基因檢測機構的資質，CFDA對產業鏈條中的儀器、試劑、分析軟件進行監管。
在淘寶上，各家檢測機構都在頁面顯眼處展示醫療執業機構許可證、醫療器械經營許可證等。但其實，這些文件只能證明機構本身具有設置醫療機構、經營醫療器械的資格，跟天賦基因檢測本身的可靠程度並無太大關係。以達安基因爲例，這家公司在多個場合強調自己是全國“首批基因測序臨牀應用試點單位”。所謂“基因測序臨牀應用試點”，全稱是“高通量測序技術臨牀應用試點”，目前包括遺傳病診斷、產前篩查與診斷、植入前胚胎遺傳學診斷、腫瘤診斷與治療這四個專業。
“天賦基因檢測”是一種基因測序，但又與用來篩查遺傳疾病的基因測序有所區別，屬於非診斷性基因測序。天賦基因檢測歸誰管、怎麼管等問題，目前尚沒有明確、具體的政策解答。
根據目前的規定，只有試點單位才能出具高通量測序技術的臨牀檢驗報告。其他的基因檢測技術則沒有限制，檢測機構只要通過了相關認證就可以應用PCR等技術，也能以科研報告的形式提供檢測服務。與“天賦基因檢測”的熱潮相對的，是仍處起步階段的監管制度和細則。
