小兒厭食症病因多種多樣，歸納有以下二種：一種是病理性的;一種是中樞神經系統受人體內外環境刺激的影響，使胃腸對消化功能的調節失去平衡。
1.全身性疾病的影響許多急、慢性感染性疾病都有厭食的表現，其中消化道疾病尤爲明顯，如消化性潰瘍、急慢性肝炎、急慢性腸炎、長期便祕等都可引起厭食。
2.藥物影響許多藥物尤其是抗生素容易引起噁心、嘔吐，如紅黴素、氯黴素、磺胺類藥物等也可導致厭食。維生素A或維生素D中毒也表現有厭食。一些抗癌藥物更容易引起厭食。
3.微量元素缺乏及某些內分泌素不足 鋅缺乏常表現有厭食，某些內分泌素如甲狀腺功能低下、腎上腺皮質激素相對不足也可表現厭食。
1.急性精神刺激：如小兒受到強烈驚嚇之後，精神萎靡、活動受抑制，食慾降低。這種厭食，往往時間不會太長，恐嚇心理過去食慾也就會恢復。
2.亞急性或慢性精神刺激：離開親人及熟悉的環境進入托兒所或其他新環境時，對新環境不適應，情緒低落，食慾降低，有時飯後出現嘔吐。家庭不幸或父母離異等。
3.頑固性神經性厭食：個別女孩神經性厭食可十分嚴重，病人極度消瘦，無力，與嚴重營養不良有類似之處。如體溫偏低，怕冷，心率減慢，血壓偏低，肢端發紺，年長女孩有閉經，貧血，並有維生素、蛋白質缺乏的特徵。
在排除孩子是病理原因引起的厭食之後，父母要放正心態。
在孩子食慾不振時，少吃一頓並無多大妨礙，反而可藉此讓已疲勞的消化腺有一個休整機會，對兒童消化功能恢復有益。多數孩子餓了自然會產生食慾，自然會吃。有些父母擔心孩子營養不良，強迫孩子多吃，並嚴厲訓斥、非吃不可，這對孩子的機體和個性都是一種可怕的壓制，使孩子認爲進食是極不愉快的事，逐漸形成頑固性厭食。
