現狀在臨牀上，根據不同疾病、不同治療目的，可選用不同的藥物進行霧化吸入。目前常用的可供吸入的藥物有以下幾種。
支氣管擴張劑主要用於解除支氣管痙攣，常用藥物有：
常用藥物爲異丙託溴胺，水溶液濃度爲0.025%。成人每次2ml，兒童每次0.4~1ml，加入等量生理鹽水霧化吸入，也可直接原液吸入，每日2~3次。吸入劑量的10%～30%沉積在肺內，胃腸道黏膜吸收量少，對呼吸道平滑肌具有較高的選擇性。吸入後10~30分鐘起效，1~2小時作用達高峯，1次吸入後作用可維持6~8小時。其主要用於COPD急性發作以及支氣管哮喘急性發作時的治療。
該藥物的不良反應極小，但也有吸入後引起急性尿瀦留的報道。因此，對於前列腺肥大、青光眼病人以及妊娠及哺乳期婦女慎用。
目前臨牀上常用的藥物有沙丁胺醇。其水溶液濃度爲0.05%，霧化後形成直徑2~4 μm 的氣溶膠顆粒，經吸入給藥10%~20%可達下呼吸道。常規使用劑量爲2 ml藥物加等量生理鹽水霧化吸入。吸入後5分鐘即可起效，15分鐘可達高峯，藥效可維持4~6小時。其主要用於重症支氣管哮喘發作以及COPD有明顯支氣管痙攣的病人。
由於此類藥物對心臟和骨骼肌的β受體也有部分激動作用，所以部分病人吸入後會出現心悸和骨骼肌震顫。有器質性心臟病、高血壓、甲亢的病人應慎用此類藥物。
常用藥物有布地奈德，具有局部高效和全身安全的特點。藥物濃度爲1mg/2ml，每次使用2ml，每日2～3次。經氣霧給出的藥量中約10%沉積在肺部，成人分佈容積約300L，兒童爲3.1~4.8L/kg，顯示其具較高的組織親和力，可發揮強有力的局部抗炎作用，小劑量就能起到治療作用。
霧化吸入布地奈德起效迅速，10~30分鐘即可發揮氣道抗炎作用，適用於重症支氣管哮喘急性發作的治療，尤其適用於兒童哮喘病人。如果與抗膽鹼能藥物及（或）β2受體激動劑聯合霧化吸入,治療效果更佳。
應當注意的是，醫師要叮囑病人在霧化吸入後徹底漱口，以防止出現口腔、咽峽部黏膜念珠菌感染。
α-糜蛋白酶雖能降低痰液黏稠度，使痰液稀釋易排出，但長期霧化吸入會導致氣道上皮鱗狀化生，並偶可致過敏反應，目前已很少應用。
鹽酸氨溴索可調節呼吸道上皮漿液與黏液的分泌；刺激肺泡Ⅱ型上皮細胞合成與分泌肺泡表面活性物質，維持肺泡的穩定；增加呼吸道上皮纖毛的擺動，使痰液易於咳出。其溶液濃度爲15mg/ml。成人每次2~4ml，每日2~3次霧化吸入。
霧化吸入抗生素對呼吸系統感染有一定的治療作用。間歇或短期預防性吸入抗生素可以有效降低上呼吸道革蘭陰性菌的菌落形成率。目前，臨牀上將抗生素的霧化吸入，主要用於治療重症病人合併革蘭陰性菌感染的醫院獲得性肺炎。
需要注意的是覆蓋在呼吸道上皮的表層液體爲等滲液，pH值爲中性。吸入抗生素的滲透壓過高或pH值過低會引起咳嗽，甚至導致氣道痙攣。
硫酸妥布黴素和頭孢他啶的pH值適於吸入給藥，吸入的抗生素應溶於生理鹽水中，濃度爲100mg/ml。
爲了增強霧化吸入的效果，或縮短霧化吸入的時間，醫師會把多種藥物溶液或混懸液混合後讓患者同時吸入。
如抗膽鹼能藥物與β2受體激動劑聯合應用具有協同作用，擴張支氣管的作用更強，具有起效迅速，作用持久的特點。臨牀可以使用上述2種藥物各2ml進行霧化吸入。但將液體混合吸入時一定要注意各種藥物的物理和化學特性及其相容性，是否存在配伍禁忌等。
一般來說，異丙託溴銨、沙丁胺醇、氨溴索、妥布黴素可以配伍。布地奈德可以與特布他林、沙丁胺醇、色甘酸鈉、異丙託溴銨、非諾特羅、乙酰半胱氨酸配伍，但不推薦將異丙託溴銨與色甘酸鈉配伍使用，因爲兩者混合後可生成類似於油質、非晶體的配合物而出現沉澱。妥布黴素不能與布地奈德和色甘酸鈉配伍。
在臨牀上，經常見到將一些靜脈用藥如糖皮質激素、氨茶鹼、慶大黴素等作爲霧化吸入的藥物使用，是不可取的。
糖皮質激素的注射劑型如地塞米松、氫化可的鬆等經呼吸道局部霧化吸入時，產生的霧化顆粒較大，達不到3～5μm的有效顆粒，因而藥物只能沉積在大氣道。由於其結構中無親脂性基團，因而與糖皮質激素受體的親和力較低，局部抗炎作用弱。其水溶性較大，與氣道黏膜組織結合較少，肺內沉積率低，很難產生療效。
茶鹼雖然可以擴張支氣管，但對氣道上皮有刺激作用，故臨牀上不主張用於霧化吸入治療。
慶大黴素由於其分子中含多個羥基和鹼性基團，屬鹼性、水溶性抗生素，在鹼性環境中呈非解離狀態，作用效果好。而膿痰的酸性和厭氧環境常影響氨基糖苷類的抗菌活性，故此類藥物用於霧化吸入有一定侷限性。
有動物試驗表明，慶大黴素既會對氣道黏膜產生刺激作用，從而引發炎性反應，氣道內炎症細胞及介質聚集，繼發性自由基損害等；又會對氣道黏膜產生毒性，使氣管黏膜上皮表面黏液纖毛清除功能受損。
另外，有研究者發現，使用生理鹽水1ml加慶大黴素4萬單位，每日2次霧化吸入，在第7天時可導致巨噬細胞的吞噬功能下降，削弱了肺部清除病原體的能力。
在臨牀使用霧化吸入治療時，醫務人員除了要注意選擇藥物及其配製等因素以外，還應該注意根據患者的情況及時調整霧化吸入藥物的配伍，以達到霧化吸入的最佳效果。
