通常來說，孩子患有自閉症與父母對孩子的家教有關，和家庭氛圍也有關。除此之外，孩子患有自閉症和遺傳因素也有着很大的關係。
一、不良的家庭環境
主要是指父母不和、分居、離異、家庭氣氛緊張等因素。據報道，多數孤蝕症患兒的父母具有孤僻冷漠、不合羣、不善交際、要求完美、親子關係疏遠、缺乏同情心等個性特徵。但近年來系統的研究業已推翻了這一觀點。儘管如此，並不是說，家庭環境與教養方式對孤獨症無足輕重。
二、教養孩子的方式不當
包括過分保護、溺愛、懲罰及母愛剝奪等。教育不當導致兒童焦慮和心理問題，是引起孤獨症的重要病因學因素。
三、和父母個性、文化程度、職業、社會經濟地位有關
現代研究認爲這可能與父母知識水平較高、經濟條件較好者能較早識別患兒的問題並能及時求醫有關，而與父母的文化程度及經濟條件並無必然的聯繫。
四、家長的性格與教育方式對孩子影響很大
如果家長是粗暴型的，不能理解孩子的需要，打擊孩子的想法，孩子的心理需要得不到滿足，只好求諸自身，那麼，他就會逐漸把心靈的閘門向外界關閉。而孩子一旦在自我的內心世界和個人世界中找到了寄託和發泄的渠道，就更不會有跟外界打交道的慾望了。
五、先天因素導致孩子自閉症
1、遺傳因素
雙生子研究顯示，孤獨症在單卵雙生子中的共患病率高達61%～90%，而異卵雙生子則未見明顯的共患病情況。在兄弟姊妹之間的再患病率，估計在4.5%左右。這些現象提示孤獨症存在遺傳傾向性。研究顯示，某些染色體異常可能會導致孤獨症的發生。
2、感染與免疫因素
早在20世紀70年代末就有研究發現，孕婦患病毒感染後，其子代患孤獨症的機率增大。後來數個研究均提示，孕期感染與孤獨症發生可能有一定的關係。目前已知的相關病原體有：風疹病毒、鉅細胞病毒、水痘——帶狀皰疹病毒、單純皰疹病毒、梅毒螺旋體和弓形蟲等。目前推測，這些病原體產生的抗體，由胎盤進入胎兒體內，與胎兒正在發育的神經系統發生交叉免疫反應，干擾了神經系統的正常發育，從而導致了孤獨症的發生。
