儘管目前北京市已全部實施免費婚檢，但檢查率逐年走低，2013年北京市婚前醫學檢查率不足十分之一。同時，婚檢人羣的疾病檢出率卻呈現逐漸上升趨勢，由1996年的5%上升到2013年的12%左右。這是北京市衛生計生委1月13日對外發布的數據。
北京市從1982年起開展婚前保健服務工作，自《中華人民共和國母嬰保健法》頒佈後，北京市婚檢率逐年提高，2003年以前已達到100%左右，2003年新《婚姻登記條例》實施後婚檢率明顯下降。
目前婚檢人羣檢出率逐步上升，疾病包括先天性心臟病、智力低下;精神性疾病，如癲癇;男性生殖系統疾病，如小睾丸、精索靜脈曲張;女性生殖系統疾病，如盆腔炎、生殖器官腫物等均呈現上升趨勢，這些疾病均與婚育有關係密切，有些造成不孕不育症的發生，有些會導致胎兒發生出生缺陷。
尤其值得注意的是，自願婚檢實施以來，性傳播疾病的檢出率與其他相關疾病不同，下降較明顯，這與目前人羣中相關疾病發生率現狀顯然不相符。據分析，這部分人羣已經知道自己有病而避免接受婚前保健服務。例如梅毒，在婚檢中檢出率雖然下降了，但同期孕期梅毒的發生率卻明顯增高，這不僅對自身及配偶產生影響，還嚴重危害下一代的健康。
