羊水穿刺主要能檢驗出唐氏症，而一些基因疾病也可透過檢驗羊水細胞內的基因得到診斷，對一些高齡孕婦來說，羊水穿刺檢查是很有必要的，那孕媽媽最擔心的是，羊水穿刺危險性大嗎？
羊水穿刺是一種侵入性診斷檢查，任何一種侵入性檢查都是存在一定的醫療風險，如造成孕婦出血、出血性休克、羊水外流、流產及傷及胎兒的可能。但是它的總風險率較低，導致胎兒流產的風險也不超過1%，只要選擇正規的大醫院，有經驗的醫生，一般危險性很小。
在手術的過程中可能會因爲準媽媽自身的原因，如腹部及子宮的異常或者是腹中羊水較少以及胎盤位置處於前壁等導致手術失敗。
如果手術前準媽媽有被感染的機率或者是在做完羊水穿刺術後沒能及時地做好清潔、衛生的工作，那麼就會有宮內感染的現象出現。
如果孕婦有合併心腦血管疾病，則會因爲術中的疼痛或緊張等刺激，而致使心腦血管出現不測。
該手術使用的工具是細針，它要穿進準媽媽的羊膜腔，在此過程中可能對母體以及腹中的胎兒有一定的危險性，比如女性出血甚至休克，致使術後流產以及危及胎兒等。
羊水穿刺是在B超引導下進行的，醫生會選擇羊水豐富且不傷及胎兒的位置進行穿刺，因此一般情況下它是十分安全的。隨着科技和臨牀技術水平不斷提高，目前羊水穿刺的安全係數已經大大提高。當然，作爲一項侵入性檢查，誰也無法保證羊水穿刺一定不會對胎兒及準媽媽造成任何影響。
羊水穿刺術後，可能會出現輕微的宮縮，這是屬於正常的。但是如果宮縮的情況比較厲害，並且相對比較有規律的，或者發現有陰道出血或者羊水滲漏的情況，要立即去醫院。這些可能是流產的先兆。還有，如果出現發燒的情況，也要馬上就醫，有可能是感染了細菌。
