藥物流產是通過服用藥物使胚胎停止發育，胚胎死亡後通過子宮收縮，從而將胚胎給流出體外。
一般女性懷孕的最後一次月經結束的那天開始算，在停經不超過49天的情況下進行藥物流產。女性的藥物流產選用米非司酮與米索前列醇這兩種，大多醫生建議選擇需要藥物流產的女性：連續2天空腹服用米非司酮，服藥後1小時最好不進食。到第三天的早晨，再空腹服用米索前列醇。在整個服藥過程結束後四到六個小時，患者就會排出胚囊。
其實藥物流產和人工流產都一樣存在妊娠終止的生理變化，對女性的身體都有傷害。女性在藥流後，最好有充足的休息，注意保暖，禁食辛辣、生冷、刺激性的食物，否則日後會有腰痠、腹疼、痛經情況，更甚者出現長期盆腔出血。
