甲亢和甲減屬於兩種疾病，引起甲亢和甲減的原因也不同。甲亢通常是遺傳、長期使用某些藥物、垂體瘤等原因引起的。甲減一般是甲狀腺破壞、自身免疫損傷或服用抗甲狀腺藥物等原因導致的。
甲亢具有遺傳傾向，如果有甲亢家族史，患甲亢的機率一般就比較大。如果長期使用含碘造影劑、胺碘酮或干擾素等藥物，也可能會引起甲亢。若患有垂體瘤，通常會分泌過多的促甲狀腺激素，從而使甲狀腺大量分泌甲狀腺激素，引起甲亢。
如果做甲狀腺次全切等甲狀腺手術，通常會破壞甲狀腺，影響甲狀腺功能，可能會導致甲減。如果出現自身免疫損傷，比如產後甲狀腺炎、萎縮性甲狀腺炎或橋本甲狀腺炎等，通常會導致甲狀腺激素合成、分泌過少，引起甲減。若服用硫脲類、鋰鹽等抗甲狀腺藥物，使甲狀腺激素合成受到影響時，通常也可能會引起甲減。
