流行性乙型腦炎的臨牀表現以發熱、意識障礙、抽搐、呼吸衰竭和腦膜刺激症等爲特徵，疾病潛伏期一般爲5-15天。具體不同時期的症狀表現如下：
起病急，主要表現爲全身不適，頭痛、發熱，常伴有寒戰等症狀。體溫急劇上升至39～40℃，伴頭痛、噁心和嘔吐，部分病人有嗜睡或精神倦怠，並有頸項輕度強直，病程1-6天左右。
此期最突出的特徵是持續發熱，體溫高達39度-40度以上，多持續5-10天，以後呈階梯下降。應中樞神經感染加重，可出現意識障礙，如精神恍惚，昏睡和昏迷等，驚厥或抽搐也比較常見，80%的患者有頸項強直表現。
乙腦在恢復期體溫逐漸下降，精神、神經系統症狀逐日好轉。重症病人仍神志遲鈍、癡呆、失語、吞嚥困難、顏面癱瘓、四肢強直性痙攣或扭轉痙攣等，少數病人也可有軟癱症狀，但經過積極治療大多數症狀可在半年內恢復，少數重症病人半年後仍有意識障礙、癡呆、失語及肢體癱瘓等精神神經症狀，爲後遺症。
通常發熱在40度以上，有昏迷、驚厥、顯著的腦膜刺激徵及神經系統的體徵。呼吸、循環均可發生衰竭。休溫多迅速上升至39—40度甚至以上，發病初1—2天內有嚴重的頭痛、頭暈、疲倦、噁心、嘔吐、嗜睡或有煩躁不安、興奮，或表情呆板、對外界反應差，眼結膜充血，瞳孔對光反應遲鈍，頸強直，嬰幼兒可出現前囟門凸出。
約經過24—28小時病情更加嚴重，體溫可高達4I度以上，出現昏迷、驚厥，肢體呈強直性或遲緩性癱瘓。在深度昏迷下，可出現大小便失禁或尿瀦留，甚至可至呼吸衰竭、死亡。
流行性乙型腦炎的臨牀表現以發熱、意識障礙、抽搐、呼吸衰竭和腦膜刺激症等爲特徵，疾病潛伏期一般爲5-15天。具體不同時期的症狀表現如下：
發熱40度左右，有頭痛、噁心、嘔吐、腦膜刺激徵，在意識障礙方面僅有不同程度的嗜睡，或煩踩不安，神志恍惚，但無昏迷，在發病後5—7天體溫開始下降至正常，一般在14—21天完全恢復，很少留有後遺療。
發熱38—39度斤右，有頭痛、噁心、嘔吐、嗜睡等症狀，無意識障礙。可有輕度的腦膜刺激徵，體溫一般在3—5天左右下降，沒有後遺症，一般7—10天左右可恢復正常。
