皰疹病毒的危害性極大，一旦感染上如果沒有進行科學有效的治療，那麼會引起許多的併發症。在新世紀裏最讓醫生們擔心的還是皰疹病毒，從某種意義上講它比當年的鼠疫和天花還要可怕，因爲人們出於無知還常常將皰疹誤認爲普通的傷風感冒。所以對於皰疹病毒一定要有一個全面的認識。
生殖器皰疹的反覆發作可給患者帶來很大的痛苦，同時，皰疹病毒傳染性強，也會危及到身邊的人。具體來說，得了皰疹病毒的危害主要有如下幾點：
1、巨大心理壓力：從心理上來說，生殖器皰疹的發生和復發會造成病人思想負擔過重，而出現心理障礙害怕致癌、害怕傳染給性伴侶、迴避與性伴侶的性生活、不願與異性交往、導致性功能障礙，影響家庭和睦，甚至發生抑鬱症。
2、孕婦可致流產、死產以及新生兒的死亡：孕婦患生殖器皰疹還影響優生優育，可能會引起子宮內感染和新生兒皰疹感染，導致流產、死產、新生兒死亡或發生嚴重後遺症。約半數以上的新生兒皰疹患者會死亡或遺留中樞神經系統的後遺症。
3、增加艾滋病的危險性：在艾滋病流行地區，生殖器皰疹還爲艾滋病毒進入人體提供通道和便利條件，從而增加了患艾滋病的危險性。
