女性卵巢的排卵後卵巢中正常黃體的形成決定於：排卵前卵泡內有足量的顆粒細胞，排卵後黃體細胞有分泌孕酮的功能，卵巢中顆粒細胞和卵泡膜細胞有對促性腺激素產生反應的受體。如果以上條件不具備，造成卵泡期和黃體期以及妊娠早期的內分泌異常，均可導致黃體功能不全。
黃體功能不全導致流產的可能原因爲：
1、卵巢卵泡發育不良，黃體形成缺陷，與血中FSH不足或缺乏和血中雌、孕激素比例過高，血中沒有出現足夠高度的LH峯值有關。
2、黃體期子宮內膜分泌延遲改變或分泌期不完全，子宮內膜的孕激素受體不足導致子宮內膜對孕激素的效應差。
3、內分泌異常，如高泌乳素血癥，甲狀腺功能低下等。
4、子宮內膜異位症；
5、其它；如因人流後及醫源性結紮等。
1)體內孕激素水平低下，干擾早期胚胎髮育，從而發生流產。據臨牀研究表明，反覆流產婦女中黃體功能不全可高達百分之二十三至百分之六十七，是造成反覆流產的主要原因之一。妊娠8周後黃體功能逐漸被胎盤取代，如在孕8周前切除黃體，將不可避免地發生流產。
2)排卵前卵泡發育異常，雌二醇分泌不足。在子宮內膜增生期，由於卵泡分泌雌二醇不足，致使子宮內膜發育遲緩。排卵後，由於卵泡發育而來的黃體分泌雌二醇的功能仍末得到改善，使孕激素不能充分作用於子宮內膜，更加重了子宮內膜發育不良，致使胚胎着牀受到障礙而致流產。有學者檢測到反覆流產中黃體功能不全患者卵泡期和黃體期雌二醇水平偏低，或孕激素和雌二醇比值低。
3)雌激素受體和孕激素受體含量不足：研究發現反覆性早期流產患者增生期子宮內膜的雌激素受體含量和(或)分泌期子宮內膜的孕激素受體含量均明顯低於正常對照組，證實激素是通過受體發揮作用，激素和受體任一方面減低或功能異常均會導致激素效應的減低，即子宮內膜發育異常。對反覆流產合併有黃體功能不全患者的治療，應先改善卵巢功能，增加雌激素的分泌；或先補充外源性雌激素，提高子宮內膜組織中的受體含量，改善內膜的反應性，才能使孕激素髮揮生理效應，保證子宮內膜正常發育成蛻膜，避免發生再次流產。
