高壓氧艙治療，一般沒有什麼明顯的後遺症。高壓氧艙治療主要是通過高濃度的氧分壓，給予患者治療，對一氧化碳中毒、腦血管病、突發性耳聾、傷口不癒合、厭氧菌感染、股骨頭壞死等等有較好的效果。臨牀上常規高壓氧治療在壓力和時間上是有一定限制的，所以可能產生的不良反應概率比較低。
臨牀上最常見的就是中耳氣壓傷，所以做高壓氧的時候一般要保證患者咽鼓管是通暢的。可以捏住鼻子進行鼓氣或通過吞嚥動作，調整鼓膜內外壓力平衡，能夠避免出現中耳氣壓傷，即使出現輕中度中耳氣壓傷，比如耳痛，經過幾天休息可以完全恢復。
再一個是減壓病，往往是在潛水作業中可能常見，臨牀常用的治療壓力下，一般不會出現減壓病。如果做高壓氧時間過長，有可能造成氧中毒，但目前常規的高壓氧艙治療都在短時間內完成，氧中毒的可能性不大。
