耳洞長肉球患者可以通過保守治療，手術治療，或者是物理治療的方式清除。
1、保守治療：耳洞長肉球，如果只是單純瘢痕增生形成時間較短，可以遵醫囑塗抹化瘢痕藥物進行治療。如積雪草凝膠、複方肝素鈉尿囊素凝膠等。
2、手術治療：如果出現耳洞里長肉球是耳廓纖維瘤導致瘤體沒有增大的情況，不需要進行特殊治療，觀察即可，若是瘤體出現持續增大，就需前往醫院採取手術切除。
3、物理治療：耳洞長肉球的部位若是比較敏感，並且使用藥物治療效果不是很好，通過手術無法進行完全切除，就可以採取冷凍、激光的方式治療。
在進行治療期間，需要做好局部衛生防護，尤其是做物理治療和手術治療的患者，避免出現感染。
