每100克南瓜中含瓜氨酸20.9毫克,以及精氨酸、天門冬酸、葫蘆巴鹼、腺嘌呤、維生素、脂肪、糖分等。南瓜子含瓜子氨酸,其脂肪油約40% ,其他尚有尿素分解酶等。
南瓜與羊肉不宜同食。《本草綱目》記載:”南瓜不可與羊肉同食,令人氣壅。”因為南瓜補中益氣，羊肉大熱補虛，兩補同食，令人腸胃氣壅。
南瓜與蝦不宜同食。同食會起痢疾，可以用黑豆、甘草解毒。
南瓜能降低血糖,對糖尿病有較好療效,並對高血壓及肝臟的一些病變有預防和治療作用;南瓜所含的甘露醇又有通大便的作用,可減少糞便中的毒素對人體的危害，防止結腸癌的發生，故被稱為"防癌食物”。南瓜中胡蘿蔔素含量較高，它是維生素A的前體，被人體攝取後，很快轉化成維生素A而被吸收利用,對保護視力具有重要作用。它還含有一種"鈷”的成分，食用後有補血作用。南瓜子除驅蛔蟲、蟯蟲外,還有殺滅血吸蟲幼蟲的作用。
南瓜與富含維生素C的食物不宜同食。
由於南瓜含維生素C分解酶,所以不宜同富含維生素C的蔬菜、水果同食。維生素C耐熱,南瓜煮熟後此酶即被破壞。所以南瓜宜煮食，不宜炒食,更不宜與番茄、辣椒等同炒。富含維生素C的菜有菠菜、油菜、西紅柿、圓辣椒、小白菜、菜花等。
