一般情況下，達託黴素和萬古黴素存在使用方法不同、作用機制不同、抗菌活性不同的區別。具體分析如下：
1、使用方法不同
達託黴素通常為注射液，一般以靜脈注射的方式給藥，而萬古黴素可分為片劑和注射劑，可通過口服或靜脈注射給藥。
2、作用機制不同
達託黴素通過破壞細菌細胞膜而發揮其抗菌作用，而萬古黴素通過干擾細菌細胞壁的合成而殺死細菌。
3、抗菌活性不同
達託黴素對革蘭陰性菌和厭氧菌治療效果相對欠佳，而萬古黴素對革蘭陰性菌同樣沒有太大的治療效果，所以在選擇藥物之前，應明確細菌感染的類型。
除以上相對常見的區別外，二者之間還存在耐藥性的影響不同、藥物的代謝程度不同、藥物的副作用不同等區別。因此，在選擇使用哪種抗生素時，患者需要根據自身的具體情況、細菌的耐藥性和藥物可能會產生的副作用等因素進行綜合考慮。
