藿香正氣水跟頭孢一起服用可能會出現雙硫侖樣反應，引起患者出現明顯的不適，甚至休克、死亡。
頭孢屬於比較常見的抗生素，含有天然頭孢菌素C，常見的劑型有頭孢克肟膠囊、頭孢地尼分散片等，而且多為甲硫四氮作唑鏈類頭孢菌素。藿香正氣水的輔料中新增有乙醇，乙醇與甲硫四氮唑側鏈類藥物容易發生反應，出現雙硫侖樣反應，引起喉頭水腫、心率增快、血壓下降等不適症狀，嚴重的還會發生過敏性休克、死亡等結果，所以藿香正氣水跟頭孢一般不能一起服用。
如果已經出現藿香正氣水跟頭孢一起服用的現象，需密切關注症狀變化，如果出現不適感需及時就醫。如果已經服用藿香正氣水，但未服用頭孢的患者，在服用頭孢前至少需停止服用藿香正氣水以及其他含有乙醇的酒類、飲料一週以上。
