懷孕發現卵巢囊腫應根據囊腫的大小和性質確定治療方法。建議儘早前往醫院就診，在完善相關檢查後積極治療。
當患者懷孕發現卵巢囊腫，應該先做腫瘤五項的檢查，評估囊腫的良惡性。如果卵巢囊腫體積較小，沒有在短時間內快速增長，一般定位為良性，可以先不用治療，注意定期複查，若考慮囊腫大於五公分，可考慮在孕14周後行囊腫剝除術，並送病理檢查，術後給予安胎治療。但是如果卵巢囊腫體積較大，且短時間內快速增長，就需要考慮是有惡性病變或者有囊腫破裂、囊腫蒂扭轉等情況，這時候則需要進行手術治療。
一般情況下，摘除卵巢囊腫的最適宜手術時間為妊娠16~24周，此時子宮相對穩定，不易引起流產或早產等，手術時應用胎兒保護藥物，抑制子宮收縮，並進行病理檢查。
